En el año 1942, en el municipio de Soacha, surgió la necesidad de brindar educación a niños y niñas que no habían logrado ingresar al sistema educativo oficial o que tenían dificultades para desplazarse a Bogotá D.C. Ante esta situación, la señora Araceli Escobar (Q.E.P.D.) decidió fundar el Colegio Niño Jesús, el cual inició sus labores con diez estudiantes en la sección de primaria.
Su principal colaboradora fue la profesora Cristina Escobar, junto con un grupo de docentes conformado por Zoila Rosa Pinzón, Fabiola Toledo, María de García, Emma Urrego, Ángel María Rojas, Germán Escobar (hijo), Fanny Chávez, Fabiola de Rico, María Cristina de Arango, Blanca Osuna, Luis Bernal, Irma de Chávez, Lucila de Lozada y Aidé Bejarano, entre otros.
En octubre de 1955 se otorgó la licencia de funcionamiento para primaria mediante la Resolución 4310, bajo la dirección de Araceli Escobar de Escobar. Posteriormente, en octubre de 1961, el Ministerio de Educación Nacional realizó una visita oficial y, mediante la Resolución 4880 de 1961, aprobó los cursos de primero a quinto grado de enseñanza primaria.
En 1993 se solicitó la visita de aprobación de estudios para los grados sexto a undécimo, con el propósito de graduar a 38 bachilleres de la primera promoción. En julio del mismo año, la Secretaría de Educación de Cundinamarca llevó a cabo la respectiva visita de inspección y, como resultado, se otorgaron las licencias de funcionamiento para los diferentes grados de bachillerato.
Finalmente, la aprobación oficial de la institución para el grado undécimo se obtuvo mediante la Resolución No. 000762 del 30 de agosto de 1999.